La FISH es un método molecular citogenético que permite cuantificar el número de copias de un gen; es usada en la investigación de anormalidades en genes y cromosomas. La FISH es considerada actualmente el estándar de oro para evaluar la amplificación del HER2/neu, debido a que los estudios del uso del trastuzumab muestran que la predicción de respuesta al tratamiento es superior usando FISH. Adicionalmente, la FISH tiene una sensibilidad y especificidad del 98% y 100%, respectivamente.

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